L'Idiap et InflamAlps, ensemble pour accélérer la recherche antibiotique
Accélérer la sélection de sources potentielles d'antibiotiques grâce à l'intelligence artificielle est l'un des objectifs du projet ABRoad. Il est mené par un partenariat intersectoriel valaisan : l'entreprise InflamAlps basée à Monthey, spécialisée dans la recherche et le développement pharmaceutique, et l'institut de recherche Idiap, basé à Martigny, expert mondial en intelligence artificielle. Soutenu par la Fondation Ark, ce projet innovant vise à développer une plateforme numérique permettant la sélection de sources potentielles d'antibiotiques.
Soutenir la découverte de médicaments, déterminer les substances bioéquivalentes et identifier de nouveaux antibiotiques sont les objectifs du projet ABRoad, qui est le fruit d'une collaboration entre la société InflamAlps, basée sur le site technologique de BioArk Monthey, et le réputé institut de recherche en intelligence artificielle, l'Idiap, à Martigny.
La conception d'une interface logicielle de traitement du langage naturel (NLP) pour soutenir la découverte de données biomédicales sur de grandes bases de données textuelles scientifiques (articles et brevets), ainsi que le développement d'un modèle permettant la comparaison de formules chimiques en plus des textes les concernant, devraient commencer cet automne.
La perspective de réduire les coûts de la recherche pharmaceutique
L'identification de sources potentielles de substances antibiotiques, pouvant ensuite être validées expérimentalement, nécessite l'interprétation de la littérature scientifique (articles et brevets) à grande échelle. Un travail titanesque !
"Comment savoir si ce que nous cherchons n'existe pas déjà ?", interroge Vincent Mutel, PDG d'InflamAlps. Grâce aux récents progrès du traitement du langage naturel (NLP), il est désormais possible d'automatiser des parties importantes de ce processus de sélection. "Les enjeux sont très importants. Il s'agit d'éviter les recherches inutiles et donc d'accélérer la découverte de nouveaux antibiotiques", explique Vincent Mutel.
Une technologie applicable à d'autres domaines !
En utilisant les méthodes de pointe développées par l'Idiap en matière d'inférence en langage naturel (NLI), le projet vise à développer une plateforme d'interprétation textuelle pour soutenir la découverte biomédicale. "Ces dernières années, ces méthodes ont évolué de manière spectaculaire pour permettre l'interprétation de preuves textuelles à grande échelle. Avec le projet ABRoad, nous démontrerons leur valeur en augmentant le processus de découverte d'antibiotiques", poursuit André Freitas, responsable du laboratoire de raisonnement et d'IA explicable (ExplAIn Lab) de l'institut de recherche Idiap.
L'infrastructure logicielle développée pour le projet ABRoad est une véritable preuve de concept de l'application des méthodes contemporaines du NLP et donnera un véritable élan stratégique aux entreprises biomédicales en Valais, et au-delà. Le projet renforce également la position du canton du Valais en tant que point central national dans le domaine du traitement du langage naturel.